就海洋污染来说，海洋监测系统的运行过程简单来说就是，通过卫星、飞机、船舶、浮标、岸基监测站等多种途径收集各种海洋污染相关的环境要素信息，然后通过无线传输等方式把数据传输给信息处理终端（通常为计算机），利用多种软件将得到的数据进行加工处理，最终得到我们想要的监测结果，并用以判断监测海域的污染情况，起到海洋污染防治的效果。
以海洋环境监测浮标为例，它的工作过程如下：各传感器收集信息并产生信号，通过仪器自动处理，由通信装置定时发出，地面接收站将收到的信号进行处理，就得到了我们所需的资料，离陆地太远的浮标则会先将信号发往卫星，再由卫星将信号传送回地面接收站。
